А, впрочем, случая не будет, разверну прямо сейчас. Одна из задач любого работника любого отдела эксплуатации - это борьба с хаосом. Вы, парни, удивитесь, но хаоса в мире гораздо больше, чем работников отделов эксплуатации. Это только в Париже могут в квартиру не входить с момента конца Второй Мировой и потом обнаружить в ней реликвии, в IT реликвии начинают копиться моментально, и при их обнаружении выживших ждет депремирование. Сейчас идеальной моделью деплоймента считается заливка на продакшн неизменнных образов операционной системы с намертво вколбашенным в них приложением. С этой точки зрения вообще все равно, что у вас там было исходно - Gentoo или не Gentoo, потому что в этих образах обычно от системы остается только самая основа, не всегда даже syslogd есть. А, если разницы нет, зачем переплачивать больше? "Потому что мы можем" - ответ валидный, если люди действительно могут, то есть, понимают, грубо говоря, из чего вообще состоит современный Linux (подсказка: из всего того же, из чего и несовременный). У меня есть друзья, которые из ВАЗ 2101 сделали в свое время мега-автомобиль с салоном из флока и электростеклоподъемниками, получился, правда, все равно ВАЗ 2101. Верить в то, что при пересборке Gentoo любым известным мне способом получится Cisco IOS - это как верить в то, что из ВАЗ 2101 можно собрать большой карьерный экскаватор.

Остается вопрос - а что в этой схеме ставить на гипервизоры, то бишь, хосты, куда приходят контейнеры. Да что угодно, развлекайтесь, как считаете нужным, лишь бы работало. Ленивый человек не будет собирать из пакли и смолы ВА3 2101, а просто возьмет Ubuntu 14.04 что в контейнер, что на гипервизор. Рассказы о том, что "я админ, и мне нужна система настроенная мной" не очень конструктивны - ты что, админ, не можешь Ubuntu 14.04 настроить? Что в Gentoo ты можешь настроить такого, что нельзя настроить где-то еще? Чепуха какая-то, достаточно один раз попробовать настроить что-нибудь действительно сложное, чтобы потом всегда, по возможности, этого избегать. Я вот настраиваю сейчас Kerberos и FreeIPA - не, ребята, второй раз не хотел бы, очень не хотел бы. Покупайте с сертификатом РосТеста.